農村信用社屬于我國特殊的地方性農村金融機構，說它特殊是因為它與國有銀行和全國股份制銀行在核算體制上有很大差別。
通俗的說，農村信用社并非全國性金融機構，在行政管理上一般以省級為單位，而在業務經營上又一般以地市級（農商行和農村合作銀行），或縣級為獨立法人（信用聯社），實行自主經營，自負盈虧。2006年經中國人民銀行批準，農信銀資金清算中心正式成立，主要服務于全國農村信用社，農村商業銀行和農村合作銀行，以及其他地方性金融機構的資金跨行清算，個人賬戶由此實現了全國農村金融機構之間的通存通兌。所以，信用社的借記卡，如果是有銀聯標識的，是可以在全國信用社、農商行和農村合作銀行之間取款的。
但是，正如前面所說，農村信用社在全國范圍之內并非一級法人制，而是以地市級或縣級為獨立法人，即全國各地農村信用社并非同一家銀行。因此，盡管可以存取款，但因為屬于跨行業務，所以是要收取手續費的。
具體收費標準為:
省內同行異地免收取款手續費。
省外異地ATM取款2元/筆+交易金額1%。
省外柜臺取款按照交易金額0.5%收取，不滿1元按1元收取，最高50元。
由此可見，如果務工和經商有跨省的資金往來的，建議還是辦理全國性銀行的借記卡最好，因為現在都是本行異地取款全部免手續費，這也會節約很多費用的。